Vicecampeón Nacional
Desde el campeonato de 1984 bajo la presidencia del Ing. Luis Chiriboga Acosta y la dirección técnica de Carlos Sevilla Delgado, el equipo chulla mostró su dedicación.

En 1985, tras 17 años de espera, la Noble Institución llegó a instancias finales, al coronarse vicecampeón nacional. El Lucho, Chiriboga y su directorio, la rifa la Gorda una singular forma de financiamiento pasó importante renglón de ingresos para el club. También se hizo una importante goleada a LDU 8-1.

Correspondiente a la antepenúltima fecha de la liguilla, disputó contra Barcelona el 8 de Diciembre en el Estadio Modelo, que le goleó 6-1, tras una insuperable ventaja de 5 puntos con aquel triunfo en Guayaquil, el título nacional.

Entonando un original cancionero copero compuesto por su "culta barra" al grito de Quito al Brasil, Filanbanco a Guayaquil, chullaS y toreros los equipos coperos. Quito, Quito, Quito hay uno solo, Quito el de la plaza saludaron el vicecampeonato de la Academia.

Con entusiasmo la fiel hinchada del Deportivo Quito y sus nuevos adherentes vieron, además surgir en sus filas a Alex Aguinaga llamado a ser un futbolista de excepción, fue elegido el mejor futbolista en el Sudamericano Juvenil de Colombia en el 1987.

Brasileros eliminados de la Copa Libertadores
En 1986 Deportivo Quito disputó en el grupo Ecuador- Brasil su tercera Copa Libertadores. Enfrentó al campeón Curitiba de la ciudad de Coritiba, al subcampeón Bangú de Río de Janeiro y Barcelona.

El domingo 20 de Abril en el Estadio Modelo empató 3-3 con el equipo torero, tras ir perdiendo 3-1 con los goleadores: del uruguayo Juan Carlos de Lima al volante Argentino Carlos Alberto Mendoza y Fausto Carrera back central.

Diario el Comercio en Guayaquil puntualiza "en los 14 últimos minutos" Deportivo Quito logró lo que parecía imposible. Yépez y de Lima se encargaron de escribir el 3-3 para la historia. El Quito había cumplido una hazaña en el puerto.

El martes 29 de Abril, ante aproximadamente 30 mil espectadores, el plantel azulgrana ganó en el Estadio Olímpico Atahualpa" a Coritiba 2-1, el domingo 4 de Mayo alcanzó su tercer éxito consecutivo imponiéndose 3-1 a Bangú con dos golazos de Juan Carlos De Lima y uno de Yépez. El Quito y su calidad destrozaron al campeón de un país que tiene el fútbol más lindo del mundo. Deportivo Quito ha demostrado en sus tres jornadas de una fiesta inolvidable a su parcialidad.

El grupo cuatro de la Copa Libertadores de América definieron a Barcelona y Deportivo Quito que tras una espectacular campaña eliminaron por primera vez en la historia del balompié ecuatoriano a los equipos brasileros.

En el Atahualpa, Barcelona igualó sin tantos con el equipo chulla, logrando clasificar invicto a seminales de la Libertadores.

En el torneo nacional Deportivo Quito se ubicó sexto, aún cuando tuvo en Juan Carlos de Lima al goleador con 23 tantos, que junto a los 9 que alcanzó en la Copa América, le valieron ser transferido en 120 mil dólares al afamado Botafogo de Sao Paulo.

Nuevo Vicecampeonato Nacional
Finalizadas las tres primeras etapas del campeonato nacional de 1987, Deportivo Quito clasificó al cuadrangular final junto a Barcelona, Filanbanco y Audaz Octubrino de Machala, certamen en la que terminó tercero.

Al año siguiente revalidó el título de subcampeón nacional. En el otro cuadrangular, grupo 1 estaba Deportivo Quito, LDUQ, Macará y Filanbanco, en los últimos partidos jugados en horario simultáneo el 13 de Noviembre de 1988 se vivió en verdadero drama. Macará faltando 8 minutos, derrotaban al representativo "chulla" 2-0 en el Estadio Atahualpa y accedía a la copa. LDU vencía en el estadio de los Chirijos de Milagro a Filanbanco y desplazaba a Macará y a los azulgrana.

Jugándose la vida, a los 89' logró el ambicionado punto para la clasificación copera, alentando por el "Quito corazón", grito estentóreo de su culta barra, de la barra de las banderas, formada en 1988 por un grupo de jóvenes seguidores en la general, actual preferencia, del estadio Olímpico Atahualpa.

En un solo partido habían clasificado primero Macará, luego Liga a la que no alcanzó su triunfo 3-2; definieron al campeón y subcampeón de la temporada, con partidos de ida y vuelta en Guayaquil y Quito.

Casi sin aliento los parciales chulla festejaron la conquista, que le permitió a la oncena de la plaza del teatro, igual que Emelec, terminar invicto en su grupo. Disputó 6 partidos, ganó 2 y empató 4, marcó 8 goles y recibió 4. Protagonistas de este memorable empate, que en ocho minutos de enjundia dio un vuelco a la historia y demostró que en el fútbol no hay nada definitivo fueron Carlos Enríquez; Angulo, Leandro Pérez, Encalada y Marcelo Aguinaga; Panchi, Alvarez y Alex Aguinaga; Barreto Mendoza y Yepez. El argentino Gustavo Guayta sustituyó a Álvarez y José Luis "Mágico" Pavón a Barreto.

Con la dirección técnica de Manuel Battaini quién sumó 22 partidos sin perder en la capital y un Aguinaga en su madurez futbolística.

El sábado 19 de noviembre en el Estadio Monumental de Barcelona se realizó el primer encuentro imponiéndose Emelec por 3-0. Lesionaron al inicio Alex Aguinaga y anuló un gol legítimo de Mendoza. El 27 de noviembre con 35 mil espectadores aproximadamente empatando Deportivo Quito y Emelec 1-1, por mal comportamiento de la hinchada emelecsista el partido tuvo que ser suspendido por media hora, lo cual perjudicó al cuadro chulla, quién atacaba vehemente con la esperanza de forzar un tercer lance para definir el campeonato, finalmente conquistado por Emelec.

En segunda etapa de copa libertadores
En 1989 Deportivo Quito cumplió su cuarta participación en el torneo copero, rivalizó en el grupo tres Ecuador - Colombia con el campeón Millonarios de Bogotá, el subcampeón Atlético Nacional de Medellín y Emelec.

Con la dirección técnica de Oscar Miguel Malbernat clasificó, gracias a la nueva reglamentación de la Confederación Sudamericana de Fútbol, a la segunda etapa de la Copa Libertadores de América. Con una victoria y dos empates, todos en casa, acumuló cuatro puntos, suficientes para alcanzar la tercera casilla.

Perdió con Emelec en Guayaquil, empató con el Nacional de Medellín el 24 de Febrero y el 3 marzo 0-0 con Millonarios en el Atahualpa. En la revancha en el Atahualpa con el campeón Emelec 1-0. El 14 de Marzo en Medellín Deportivo Quito cayo 2-1 ante el subcampeón colombiano Atlético Nacional.

En la segunda ronda de la Libertadores, el cuadro chulla empató con Cobreloa, campeón de Chile. El árbitro boliviano que en 1983 había perjudicada a la selección ecuatoriana, expulsó injustamente a Aguinaga, el finalizar el primer tiempo, agredido por un defensor chileno.

Posteriormente Alex Aguinaga, mejor futbolista ecuatoriano, fue transferido al Necaxa de México en 250 mil dólares. Con enorme nostalgia los seguidores de Deportivo Quito y en general la hinchada ecuatoriana vieron alejarse a la nueva estrella de nuestro balompié. Condición que rubricó el domingo 4 de junio de 1995 en el Estadio Azteca, cuando convirtió un gol e iniciaron el camino de la Liga Mexicana de Fútbol, tras medio siglo de frustraciones

Una Final controversial
En 1989, el cuadro chulla, revalorizando su historia y rubricando la buena campaña durante el lustro al ser el equipo de AFNA mejor ubicado en los torneos nacionales, fue activo protagonista del torneo nacional. Después de nueve confrontaciones, el cuadro torero con 13 puntos, Emelec y Deportivo Quito con 11 y medio cada uno, quedaron como firmes aspirantes al título y subtitulo de la temporada. A Barcelona le bastaba empatar el domingo 10 de diciembre en el Atahualpa para cornearse campeón, pero un golazo de Mendoza a los '78, cuando los azulgrana jugaban en inferioridad numérica por expulsión de Encalada, igualó las posiciones con el balet azul que terminó imponiéndose cómodamente en el Modelo 4-2 al Nacional y clasificó a la Copa Libertadores.

El cotejo entre chullas y toreros no pudo concluir, restando 5 minutos a los '85, por falta de garantías fue suspendido por el árbitro cuando el público, siguiendo una nociva costumbre, invadió la cancha.